Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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CAPRIN1Q14444 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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CAPRIN1Q14444 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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CAPRIN1Q14444 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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CAPRIN1Q14444 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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CAPRIN1Q14444 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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