Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms