Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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PKP1Q13835 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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PKP1Q13835 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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PKP1Q13835 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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PKP1Q13835 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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PKP1Q13835 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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PKP1Q13835 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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