Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGA9Q13797 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms