Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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