Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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