Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BFSP2Q13515 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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