Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCGQ13326 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
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SGCGQ13326 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SGCGQ13326 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SGCGQ13326 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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SGCGQ13326 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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SGCGQ13326 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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SGCGQ13326 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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