Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF5Q13243 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SRSF5Q13243 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms