Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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