Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
DUSP4Q13115 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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