Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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