Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMARCB1Q12824 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMARCB1Q12824 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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