Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
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GTF3C1Q12789 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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GTF3C1Q12789 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
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GTF3C1Q12789 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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