Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SREBF2Q12772 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SREBF2Q12772 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SREBF2Q12772 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SREBF2Q12772 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SREBF2Q12772 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms