Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TTPAP49638 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TTPAP49638 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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TTPAP49638 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTPAP49638 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
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TTPAP49638 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TTPAP49638 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TTPAP49638 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TTPAP49638 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TTPAP49638 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TTPAP49638 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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TTPAP49638 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TTPAP49638 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TTPAP49638 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TTPAP49638 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
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TTPAP49638 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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TTPAP49638 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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TTPAP49638 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TTPAP49638 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TTPAP49638 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TTPAP49638 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TTPAP49638 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TTPAP49638 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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TTPAP49638 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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TTPAP49638 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TTPAP49638 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
TTPAP49638 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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