Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
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CENPFP49454 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
CENPFP49454 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
CENPFP49454 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CENPFP49454 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
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CENPFP49454 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
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CENPFP49454 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.24□□□□□ -2.61
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CENPFP49454 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
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CENPFP49454 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
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CENPFP49454 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
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CENPFP49454 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPFP49454 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPFP49454 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPFP49454 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPFP49454 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPFP49454 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CENPFP49454 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPFP49454 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPFP49454 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPFP49454 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPFP49454 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPFP49454 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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CENPFP49454 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
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CENPFP49454 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CENPFP49454 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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