Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms