Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
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PTPRGP23470 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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PTPRGP23470 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRGP23470 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRGP23470 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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