Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
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PTPRDP23468 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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