Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, human

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene	UniProt Accession	Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1	P21675	MTND5P5-201	ENST00000503764	376 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNA5SP384-201	ENST00000516615	116 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU6-307P-201	ENST00000516743	106 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU6-295P-201	ENST00000516901	104 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	LINC01195-201	ENST00000570118	451 nt	TSL 3 BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	7SK.7-201	ENST00000603504	247 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL133255.1-201	ENST00000606374	441 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	LINC02112-205	ENST00000606744	236 nt	TSL 1 (best) BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AKAP9-203	ENST00000359028	12247 nt	APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	LRRC70-201	ENST00000334994	2249 nt	APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU6-694P-201	ENST00000364071	147 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	SNORD42.2-201	ENST00000365570	69 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL117339.3-201	ENST00000418733	162 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC007098.1-201	ENST00000420122	367 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC243428.1-201	ENST00000421099	264 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL356277.2-201	ENST00000421318	441 nt	TSL 2 BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	Z82205.1-201	ENST00000428456	297 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL035666.1-201	ENST00000446195	348 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	FO393415.2-201	ENST00000480085	343 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AK3P2-201	ENST00000507976	429 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC025871.1-202	ENST00000518819	432 nt	TSL 3 BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	LINC02309-201	ENST00000553679	207 nt	TSL 3 BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RPS15AP11-201	ENST00000594193	385 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC020895.1-201	ENST00000595362	272 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL391813.1-201	ENST00000603098	260 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	NEB-220	ENST00000618972	26307 nt	APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	SNX16-212	ENST00000615066	1918 nt	TSL 5 BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	FSIP2-206	ENST00000611759	3882 nt	APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU4-56P-201	ENST00000364700	142 nt	BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU6-99P-201	ENST00000364721	107 nt	BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNA5SP240-201	ENST00000365355	128 nt	BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	Y_RNA.431-201	ENST00000384086	102 nt	BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU6-692P-201	ENST00000384496	107 nt	BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU6-1050P-201	ENST00000410388	107 nt	BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL513008.1-201	ENST00000412701	161 nt	TSL 5 BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	CYCSP49-201	ENST00000420810	319 nt	BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RPL7P42-201	ENST00000481005	679 nt	BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC116655.1-201	ENST00000508324	901 nt	BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	LINC01256-201	ENST00000513270	508 nt	TSL 2 BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC108037.1-201	ENST00000514103	423 nt	TSL 3 BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU6-470P-201	ENST00000515954	104 nt	BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL157688.1-201	ENST00000555990	369 nt	TSL 3 BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC023906.2-201	ENST00000558343	462 nt	TSL 3 BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	SCOC-AS1-203	ENST00000609616	405 nt	TSL 3 BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC006157.1-201	ENST00000611750	366 nt	BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	HMGB1P24-202	ENST00000615653	685 nt	BASIC	2.53	□□□□□ -2
TAF1	P21675	PCDH11Y-203	ENST00000362095	4220 nt	APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC	2.53	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	CEP162-201	ENST00000257766	5063 nt	TSL 1 (best) BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	RNU6-1285P-201	ENST00000363480	105 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	RNU6-596P-201	ENST00000365395	98 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	Y_RNA.482-201	ENST00000384377	111 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	TRAJ31-201	ENST00000390506	57 nt	APPRIS P1 BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	MTCYBP4-201	ENST00000401524	249 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	LINC01549-201	ENST00000440664	714 nt	TSL 3 BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AC005741.1-201	ENST00000511094	432 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AC008083.3-202	ENST00000552063	277 nt	TSL 3 BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	FRG2DP-202	ENST00000566967	323 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AC130469.1-201	ENST00000597256	388 nt	TSL 5 BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AL160287.1-202	ENST00000638113	454 nt	TSL 5 BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	ZNF260-205	ENST00000593142	4047 nt	APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AC130466.1-201	ENST00000636354	4683 nt	TSL 5 BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	MIR369-201	ENST00000362155	70 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	RNU6-227P-201	ENST00000362865	103 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	SNORD114-19-201	ENST00000363072	75 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	Y_RNA.356-201	ENST00000365475	113 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	Y_RNA.460-201	ENST00000384255	102 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	TRAJ6-201	ENST00000390531	62 nt	APPRIS P1 BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	MIR1302-11-201	ENST00000408051	138 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	MIR1302-9-201	ENST00000408365	138 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	MIR1302-10-201	ENST00000408734	138 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AP000275.1-201	ENST00000411943	390 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AL161935.1-201	ENST00000420945	421 nt	TSL 3 BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AL445685.2-201	ENST00000422551	342 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	USMG5P1-201	ENST00000425964	177 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AL358075.3-201	ENST00000426289	226 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AC108667.1-201	ENST00000428618	249 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AC007969.2-201	ENST00000441891	191 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	CFAP100-207	ENST00000510833	481 nt	APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	RNA5SP402-201	ENST00000517148	110 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AC022616.4-201	ENST00000522985	181 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	MIR1302-2-201	ENST00000607096	138 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	UCA1.1-201	ENST00000620952	75 nt	BASIC	2.52	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	RASSF8-210	ENST00000541490	5505 nt	APPRIS P1 TSL 5 BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AC233981.2-201	ENST00000611524	1614 nt	BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	MIR9-3-201	ENST00000385084	90 nt	BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	Y_RNA.594-201	ENST00000410373	140 nt	BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	RNU6-321P-201	ENST00000410912	106 nt	BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	NCOA7-AS1-201	ENST00000429007	501 nt	TSL 3 BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AC006026.2-201	ENST00000457376	180 nt	BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	Y_RNA.631-201	ENST00000459607	101 nt	BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AC093303.1-201	ENST00000514549	295 nt	BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	RNU6-1170P-201	ENST00000515974	106 nt	BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AC023442.1-201	ENST00000531247	422 nt	BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AC004486.1-201	ENST00000546846	233 nt	BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AC009120.5-201	ENST00000561669	475 nt	TSL 5 BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	MIR3670-2-201	ENST00000582974	65 nt	BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	MIR3670-1-201	ENST00000584160	65 nt	BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	MIR3670-3-201	ENST00000584855	65 nt	BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	MIR3976-201	ENST00000606807	139 nt	BASIC	2.51	□□□□□ -2.01
TAF1	P21675	AL050343.2-201	ENST00000607338	280 nt	BASIC	2.51	□□□□□ -2.01

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