Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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