Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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TNIP3Q96KP6 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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TNIP3Q96KP6 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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TNIP3Q96KP6 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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TNIP3Q96KP6 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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TNIP3Q96KP6 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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