Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.6 ms