Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCBQ16585 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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