Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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RPE65Q16518 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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RPE65Q16518 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
RPE65Q16518 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
RPE65Q16518 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
RPE65Q16518 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.59□□□□□ -2
RPE65Q16518 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RPE65Q16518 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPE65Q16518 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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RPE65Q16518 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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RPE65Q16518 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPE65Q16518 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RPE65Q16518 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RPE65Q16518 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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RPE65Q16518 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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RPE65Q16518 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPE65Q16518 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPE65Q16518 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RPE65Q16518 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RPE65Q16518 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPE65Q16518 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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