Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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