Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms