Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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SEC23BQ15437 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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SEC23BQ15437 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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SEC23BQ15437 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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SEC23BQ15437 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEC23BQ15437 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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