Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PCOLCEQ15113 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms