Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms