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| BRD3 | Q15059 | AC116337.1-201 | ENST00000509680 | 687 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNA5SP490-201 | ENST00000517141 | 136 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | PRELID2P1-201 | ENST00000552837 | 301 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC135178.3-204 | ENST00000585181 | 451 nt | TSL 2 BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | MALAT1-207 | ENST00000613376 | 132 nt | TSL 3 BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | ST7-OT4_2.1-201 | ENST00000619089 | 172 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL591030.1-201 | ENST00000626131 | 627 nt | TSL 3 BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
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| BRD3 | Q15059 | DDIAS-201 | ENST00000329143 | 3367 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
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| BRD3 | Q15059 | RNU6-845P-201 | ENST00000362578 | 103 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC005668.1-201 | ENST00000571142 | 476 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL589935.1-202 | ENST00000612512 | 393 nt | TSL 5 BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | WARS-244 | ENST00000627608 | 123 nt | TSL 5 BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-1159P-201 | ENST00000362933 | 107 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.99-201 | ENST00000363138 | 105 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.166-201 | ENST00000363730 | 102 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
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| BRD3 | Q15059 | RNU6-596P-201 | ENST00000365395 | 98 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR518A2-201 | ENST00000384966 | 87 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA40.19-201 | ENST00000390846 | 128 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SKP284-201 | ENST00000411002 | 343 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL355314.2-201 | ENST00000427182 | 436 nt | TSL 3 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPS3AP52-201 | ENST00000435639 | 297 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | HMGN2P18-201 | ENST00000450680 | 270 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC055764.1-201 | ENST00000454526 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | PMCHL2-203 | ENST00000457791 | 237 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | FO393415.2-201 | ENST00000480085 | 343 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
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| BRD3 | Q15059 | RNU6-1098P-201 | ENST00000516772 | 96 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC079600.2-201 | ENST00000550076 | 130 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | EIF4BP1-201 | ENST00000554881 | 351 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPS3AP23-202 | ENST00000574601 | 686 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR4529-201 | ENST00000578110 | 78 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | LARP7P3-201 | ENST00000579888 | 337 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF667-AS1-209 | ENST00000601875 | 495 nt | TSL 3 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL17P51-201 | ENST00000605218 | 238 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL359314.1-201 | ENST00000616913 | 261 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC137590.2-201 | ENST00000619709 | 240 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | NCBP1-205 | ENST00000629069 | 249 nt | TSL 5 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC099654.14-201 | ENST00000638599 | 341 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| BRD3 | Q15059 | DEFB134-201 | ENST00000382205 | 314 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL356057.3-201 | ENST00000402607 | 340 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-174P-201 | ENST00000410406 | 106 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC074085.1-201 | ENST00000413598 | 418 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC011816.1-201 | ENST00000441346 | 546 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC107399.1-201 | ENST00000451226 | 265 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORD5.1-201 | ENST00000458800 | 75 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC055731.1-201 | ENST00000474387 | 401 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SKP24-201 | ENST00000515888 | 284 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SKP132-201 | ENST00000516001 | 208 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-1016P-201 | ENST00000516689 | 94 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU2-19P-201 | ENST00000517288 | 84 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC087664.2-201 | ENST00000522898 | 551 nt | TSL 4 BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL132819.1-201 | ENST00000555595 | 208 nt | TSL 3 BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC016727.2-201 | ENST00000603988 | 621 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL033523.1-201 | ENST00000605153 | 153 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU1-76P-201 | ENST00000362903 | 159 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA16B-201 | ENST00000364674 | 135 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU4-9P-201 | ENST00000364951 | 139 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.339-201 | ENST00000365325 | 102 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA18.2-201 | ENST00000383865 | 132 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01344-201 | ENST00000420760 | 261 nt | TSL 3 BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL132875.2-201 | ENST00000436418 | 325 nt | TSL 5 BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | HMGB1P18-201 | ENST00000438801 | 619 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | LNX1-AS1-203 | ENST00000511989 | 488 nt | TSL 2 BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNA5SP282-201 | ENST00000516355 | 108 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |