Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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