Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3AQ14563 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms