Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NEDD9Q14511 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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