Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
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