Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms