Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms