Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SRSF6Q13247 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SRSF6Q13247 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms