Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GRIN2BQ13224 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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