Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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