Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
USP4Q13107 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
USP4Q13107 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
USP4Q13107 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
USP4Q13107 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
USP4Q13107 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
USP4Q13107 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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USP4Q13107 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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USP4Q13107 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
USP4Q13107 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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USP4Q13107 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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USP4Q13107 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
USP4Q13107 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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USP4Q13107 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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USP4Q13107 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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USP4Q13107 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
USP4Q13107 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
USP4Q13107 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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USP4Q13107 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
USP4Q13107 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
USP4Q13107 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
USP4Q13107 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
USP4Q13107 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
USP4Q13107 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
USP4Q13107 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
USP4Q13107 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
USP4Q13107 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
USP4Q13107 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
USP4Q13107 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
USP4Q13107 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
USP4Q13107 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
USP4Q13107 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
USP4Q13107 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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