Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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IFT88Q13099 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
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IFT88Q13099 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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IFT88Q13099 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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IFT88Q13099 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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