Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms