Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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