Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
RPS29P62273 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RPS29P62273 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RPS29P62273 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC-0.96□□□□□ -2.56
RPS29P62273 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RPS29P62273 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RPS29P62273 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RPS29P62273 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RPS29P62273 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RPS29P62273 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
RPS29P62273 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RPS29P62273 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.9 ms