Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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HOXD13P35453 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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HOXD13P35453 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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