Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
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PTPRMP28827 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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PTPRMP28827 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
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PTPRMP28827 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
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PTPRMP28827 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
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PTPRMP28827 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
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