Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms