Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms