Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTXN3Q4LDR2 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms